供给侧结构性改革是化肥行业转型升级的重要探索，化肥行业适应农业减肥增效目标、压缩落后产能，是行业谋求发展绕不过的话题。2018年政府工作报告提出：“坚持用市场化法治化手段，严格执行环保、质量、安全等法规标准，化解过剩产能、淘汰落后产能”。在十三届全国人大一次会议举行的记者会上，国家发改委副主任宁吉喆表示，去产能是推进供给侧结构性改革的重要任务。
宁吉喆谈到，今年去产能要重点做好“破、调、改、安”四件事——继续破除无效供给，调整优化行业结构，推进企业兼并重组，做好职工安置和债务处置。“去产能过程要始终坚持市场化、法治化、规范化的原则，如果有地方出现侵犯企业合法权益的行为，不按规范去产能，一旦发现坚决纠正。”
除了继续破除无效供给，今年的去产能工作重点还有“调”。宁吉喆解释称，“调”是要调整优化行业结构，统筹做好化解过剩、优化结构、保障供给等工作，逐步实现从总量性去产能为主向结构性去产能、系统性优产能为主的转变。同时要加强行业运行监测分析，及时采取有效的措施，促进价格保持在合理区间，不能暴涨暴跌。
国家针对钢铁、煤炭等领域去产能的做法，对化肥等农资行业具有示范作用。全国人大代表、金正大集团董事长万连步提出，利用技术创新使化肥行业“减肥”：“把产业做小，技术仍是关键。未来化肥施用量在现有基础上减量30%也有可能，但是，如果技术、服务不到位，减量的过程中也容易出问题。”他认为，在农业生产从一家一户小规模生产向规模化生产过渡，新技术、新产品的推广仍有很大的提升空间，而在这个过程中，政府主导推广新技术、新产品效果更好。
还有部分代表、委员的观点是，希望国家能够制定涉及处置相关的金融、财税、土地、就业等一揽子政策，稳妥处置“僵尸企业”。对于企业而言，高质量发展的落脚点在于“做高质量的好产品”。
